mysql 分表问题，哪一种会更有性能呢？

业务：
有1大批基因，按2中方式分类：1类是按 功能，另1类是按 代谢途径。
此外，1个基因可能同属于多个功能、或者多个代谢途径。
平时主要是通过 功能、或代谢途径 获得相应类别下的所有基因，或者查询某个基因给出相应的代谢途径或功能。

想法：
我想到了2种分表方式，但不知道哪一种更好，所以想请大家给我点建议，甚至提出更好的分表方式更欢迎。我还有想知道一般数据库的性能测试一般都怎么做的呢？有一些经验或者书可以推荐的话那就更好了，先事先感谢大家的关注。

---方式1
1. 表1 代谢途径：category_id（index，自增） / name 类名
2. 表2 基因功能：category_id（index，自增） / name 类名
3. 表达 基因：gene_id（index，用唯一的通用的ID名，不一定自增） / category_id（对应上面的功能、或代谢途径） / type（1代表对应代谢途径，2代表对应基因功能的id）

此方式在此方式搜寻或者join的时候，仅能 用 ON 代谢途径/基因功能.category_id = 基因.category_id 衔接后，加一个where 基因.type=1/2。

---方式2
1. 表1 代谢途径：
/ category_id（index，自增）
/ name 类名
2. 表2 基因功能：
/category_id（index，自增）
/ name 类名
3. 表达 基因：
/gene_id（index，用唯一的通用的ID名，不一定自增）
/category_id（以num-category_id形式储存，如{1-category_id}；或是{2-category_id}；category_id对应上面的功能、或代谢途径中的id；前面的1代表对应代谢途径，2代表对应基因功能的id）

此方式搜寻或者join的时候可以 用 ON 代谢途径/基因功能.concat('1或者2', '-', category_id) = 基因.category_id 链接到一起